Den seksten år gamle skoleeleven Shinichi Kudo er en av Japans største detektiver ? sin unge alder til tross. Han er Sherlock Holmes-fan og en fryktet forbryterjeger. En dag kommer han på sporet av en stor forbrytelse, og før han vet ordet av det er han blitt forgiftet og forvandlet til et barn igjen. Med kropp som en seksåring og nytt navn, Conan Edogawa, fortsetter han sin kamp mot ondskapen. Denne gang er det historien om Rans venninnes storesøster det handler om. Hun har gått på filmskole, og de yngre jentene får være med når de holder sammenkomst for noen gamle studiekamerater. Conan er selvfølgelig også med, og som alltid blir det behov for hans tjenester. Snart begynner hodene å rulle. Mesterdetektiven Conan er en spennings-/mysterie-manga.